ディレクトリの比較コマンドにより、２つのディレクトリをサブディレクトリを含めて、または含めないで比較することができます。ディレクトリの比較では、一方には無いファイルや、同名のファイルでも内容が同一であるかどうかが表示されます。
２つのディレクトリを比較するには：
| 1. | 「ツール | ディレクトリの比較」をクリックします。以下のダイアログが表示されます： |
| 2. | 比較するディレクトリを指定します。比較する対象にサブディレクトリも含める場合は、サブディレクトリを含むチェックボックスにチェックを入れてください。 |
| 3. | ファイルの種類フィールドにて、比較を行いたいファイルの種類を選択します。ドロップダウンメニューからは、(i) XML ファイルタイプ、(ii)(ii) XMLSpy にて定義されたファイルタイプ(iii) 全てのファイルタイプを選択することができます。 |
| 4. | 「OK」 をクリックします。（ 比較オプションにて記述される）設定ダイアログが表示されます。 |
| 5. | ファイルの比較を行うための設定を選択します。 |
| 6. | 「OK」をクリックします。比較の進捗状態を示すダイアログが表示されます。 |
比較の結果が、以下に示されるウィンドウに表示されます：
ディレクトリシンボル
ディレクトリの名前は、全て黒色で表示されます。
ディレクトリは縮退されており、コンテンツは表示されていません。
ディレクトリは展開されており、コンテンツがその行以下に表示されます。
ディレクトリにはファイルが含まれており、中に含まれるファイルは、比較することができないか、比較対象となるファイルと同一のものです。
比較対象のディレクトリには含まれていないファイルが、このディレクトリに含まれています。
比較対象のディレクトリに含まれているファイルとは内容が異なるファイルがこのディレクトリに含まれています。
比較対象のディレクトリには含まれていないファイルが１つ以上、また、比較対象のディレクトリに含まれているファイルとは内容の異なるファイルが１つ以上、このディレクトリには含まれています。
ファイルシンボル
比較ステータスにより、ファイル名の表示に使用される色が以下のように変化します：
 | 比較対象となるファイルと比較を行うことができません。中間のカラムに疑問符が表示されます。ファイル名は黒色で表示されます。 |
 | 比較対象となるファイルと同一のファイルです。中間のカラムに等号記号が表示されます。ファイル名は黒色で表示されます。 |
 | 比較対象となっているディレクトリに、このファイルは存在しません。中間のカラムには何も表示されず、ファイル名は水色で表示されます。 |
 | 比較対象となるファイルと内容が一致せず、比較対象のファイルと比べて、最終更新日時が新しいことを表します。（最終更新日時が）新しい方のファイルは明るい赤色で表示され、中間カラムにあるアイコンも、新しいファイルがある方向に明るい赤色が表示されます。 |
表示オプション
•結果ウィンドウの下部にある表示ペインにあるチェックボックスを操作することで、表示するファイルの種類の選択することができます.
•ディレクトリペインにあるボタンをクリックすることで、全てのサブディレクトリを展開、または縮退することができます。
•フォルダーアイコンをダブルクリックすることで、サブディレクトリを展開または縮退することができます。
•ファイルのタイトルバーを右クリックして、サイズと最終更新日をクリックすることで、サイズと最終更新日の表示を切り替えることができます。
•カラムをドラッグすることで、カラムの幅を変更することができます。
•結果ウィンドウは、移動、最小化、そして大きさを変更することができます。
ファイルの比較とマージ
結果ウィンドウに表示されている行をダブルクリックすることで、両方のファイルがメインウィンドウで開かれ、両方のファイルに対してファイルの比較が行われます。その後は、通常の比較セッションと同様に進めることができます（ 開いているファイルと比較...)を参照ください）。
