I manage to get this working.
Here is the xsl:

<xsl:stylesheet version="1.0"
xmlns:xsl="http://www.w3.org/1999/XSL/Transform"> 
<xsl:output method="xml" version="1.0" encoding="UTF-8" indent="yes"/> 

<xsl:key name="keyGroup"
match="//Item/Destination/*[contains(local-name(),'Code_E')]"
use="concat(.,../../AltDest)"/> 


<xsl:template match="/"> 
	<xsl:element name="Orders"> 

	<xsl:apply-templates
select="//Item/Destination/*[contains(local-name(),'Code_E')][generate-i
d(.) = generate-id(key('keyGroup',concat(.,../../AltDest))[1])]"
mode="modeitems"/> 
	</xsl:element> 
</xsl:template> 


<xsl:template match="*[contains(local-name(),'Code_E')]"
mode="modeitems"> 
	<xsl:variable name="currentKey"> 
		<xsl:value-of select="concat(.,../../AltDest)"/> 
	</xsl:variable> 	
	<xsl:element name="Order"> 
		<xsl:element name="currentKey">
			<xsl:value-of select="$currentKey"/> 
		</xsl:element>
		<xsl:element name="Code"> 			
			<xsl:value-of select="."/> 
		</xsl:element> 
		<xsl:element name="DC"> 			
			<xsl:value-of select="../../AltDest"/> 
		</xsl:element> 
		<xsl:apply-templates
select="//Item/Destination/*[contains(local-name(),'Code_E')][concat(.,.
./../AltDest) = $currentKey]" mode="modeitem"/> 
	</xsl:element> 
</xsl:template> 

<xsl:template match="*[contains(local-name(),'Code_E')]"
mode="modeitem"> 
	<xsl:element name="Item"> 
		<xsl:copy-of select="../../Item_Name"/> 
		<xsl:element name="Qty"> 			
			<xsl:value-of select="following-sibling::*[1]"/> 
		</xsl:element> 

	</xsl:element>

</xsl:template> 

</xsl:stylesheet>






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